实时直播
2019年10月24日（周四）19:00
医药加平台网络课堂
第【5】期
《基于生信工具指导项目申请的思路》
01课程简介
2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目，批助金额总计441310万元。其中面上项目数量占45%，金额占57%；青年科学基金项目数量占43%，金额占20%。
初步统计，这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中，与通路（pathway）关联的有1349项，金额4.89亿；与miRNA相关的有630项，金额2.3亿；与lncRNA相关的有395项，金额1.45亿；与circRNA相关的有230项，金额0.84亿；与m6A甲基化相关的有124项，金额0.49亿。
如何查找筛选疾病的关键靶标mRNA，Protein，lncRNA，circRNA，miRNA，Mutation等）是项目申请时常见的问题。随着后基因组时代的来临，基于生信方法工具进行靶标预测是比较主流的思路。常见的生信思路有：
（1） 对于有样本组织的，可以获取高通量数据进行挖掘转录组：RNA-seq，lncRNA-seq，circRNA-seq，miRNA-seq；基因组：全基因重测序、外显子测序、snp芯片等；表观组：DNA甲基化，M6A甲基化；其他还有宏基因组测序、chip-seq、蛋白组、代谢组、单细胞测序、外泌体测序等。
（2） 没有样本组织的，可以公共数据库挖掘TCGA、NCBI GEO、NCBI SRA、EBI ArrayExpress、CGGI等含有高通量数据的数据库。
（3） 有显著疗效中药复方的，可以进行中药网络药理学分析。
（4） 有较多参考文献的，可以进行meta分析。在这些分析的思路中，有些是近几年非常热门的思路，比如：单细胞测序、m6A甲基化、ceRNA假说、中药网络药理学、外泌体测序等。
项目类型
题目
金额/万元
重点项目
FXYD3介导的信号网络对肠道黏膜免疫稳态的调控研究
300
重点项目
基于蛋白-蛋白相互作用精准调节转录因子Nrf2活性及探索其作为肝细胞癌治疗的新靶标
298
重点项目
miR-23b/24-1簇防治烧伤后脓毒症所致MODS的系统研究
297
面上项目
LZTR1基因突变导致的RAS/MAPK通路过度激活以及Noonan综合征相关肥厚型心肌病的机制研究
60
面上项目
SUGP2基因及其突变在遗传性血色病中的致病作用及其机制研究
60
面上项目
WDR73基因突变在Galloway-Mowat综合征中的致病机制研究
60
面上项目
STAG2通过ERK/AKT/GSK3β/c-Myc反馈通路调节甲状腺癌谷氨酰胺代谢的机制研究
60
面上项目
m6A RNA甲基化修饰及其调控基因在结直肠癌发生发展中的作用和机制研究
60
面上项目
孕早期维生素A缺乏介导ceRNA网络失调致先天性脊柱侧凸的机制研究
60
面上项目
LncRNA FOXF1靶向调控动力相关蛋白1表达在缺氧诱发肺动脉内皮细胞焦亡中的作用及分子机制
55
我们这次课程基于项目申请和文献发表的角度，给大家介绍生信工具的使用方法。并给出几个实际例子，比如如何通过测序手段筛选课题目的基因，如何通过TCGA数据库进行ceRNA分析并筛选癌症关键lncRNA等。
参考文献：
Expression profiles analysis identifies a novel three-mRNA signature to predict overall survival in oral squamous cell carcinoma. Am J Cancer Res 2018;8(3):450-461
Construction of Potential Glioblastoma Multiforme-Related miRNA-mRNA Regulatory Network. ORIGINAL RESEARCH
02讲师简介主讲人：宋伟博士， 中国精准医疗分会委员
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：有十多年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：在全国上海、北京、广州、沈阳、济南、武汉等城市举办过几十场培训班。
03观看方式
1.关注【医药加平台】公众号；
2.识别以下二维码，即可进入免费领取课程通道。
3.如果您有其它问题，请添加医药加小编微信进行咨询。
医药加金牌讲师团会在现场给学员们面授科研策略与技能。
医药加金牌学习班特色：
医药加金牌学习班自开办以来，已经成功举办了几百期，培训了全国（包涵港、澳、台地区）及加拿大、丹麦、澳大利亚等国家超过千家科研单位的近万名学员。良好的课堂氛围和讲师耐心的课后跟进，获得了学员的交口称赞。医药加金牌学习班，是让学员们真正能够学以致用，在科研上更上一层楼的学习班。
10-11月份医药加学习班课程安排
咨询报名：请加学习班秘书微信bioojia01
10.19-20北京金泰绿洲酒店第37期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班10.19-20北京金泰绿洲酒店单细胞测序数据分析挖掘与研究思路面授会10.19-20上海中兴和泰酒店第13期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班10.26-27上海好望角饭店第11期TCGA/GEO高通量公共数据库挖掘学习班10.25-27长春金安大饭店第47期循证医学与meta分析（含网状meta分析）三天精讲学习班10.26-27上海中兴和泰酒店第7期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班10.26-28上海中兴和泰酒店第16期基因编辑技术学习班11.2-3号北京金泰绿洲酒店2020国自然基金标书课题构思辅导班（含有个性化点评辅导）11.9-10广州南洋长胜酒店2019全国AI科研作图高级学习班11.9-10广州南洋长胜酒店第11期肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班11.9-10广州南洋长胜酒店2020国自然基金标书课题构思辅导班（含有个性化点评辅导）11.8-10北京金泰绿洲酒店第48期循证医学与meta分析（含网状meta分析）三天精讲学习班11.9-10北京金泰绿洲酒店临床研究设计与实用医学统计研讨班11.9-10北京金泰绿洲酒店第15期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班11.16-17上海中兴和泰酒店基于R语言的机器学习与医学研究11.16-17上海中兴和泰酒店高通量数据挖掘与网络构建作图班11.23-24上海中兴和泰酒店非编码RNA数据分析与课题设计学习班11.23-24上海中兴和泰酒店临床研究设计与实用医学统计研讨班11.23-24清华伯克利深圳学院单细胞测序数据分析挖掘与课题设计面授会11.22-24清华伯克利深圳学院第38期调控性非编码RNA与外泌体研究实战研讨班11.22-24清华伯克利深圳学院python语言零基础三天学习班11.30-12.1北京金泰绿洲酒店第8期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班
【标书全文鉴赏】5份经典国自然中标标书全文，案例解读、优劣分析
国自然套路（非编码，外泌体，甲基化等热点）集合，课件+视频+文献下载
利用伞状综述发的一篇IF:19分的文章分享
2019年国自然医学部全部31个学科项目excel清单下载
SCI选刊到录稿，最完整8个环节资源限时免费领取
2020国自然准备套路：9种常见分子机制与常见实验方法
全套最新生物医学研究套路手把手教学视频，限时免费
